病因和发病机制慢性胃炎的病因尚未完全明了，目前认为是由多种因素作用造成。
简要如下。
（1）幽门螺杆菌感染：
研究证明幽门螺杆菌（Hp）是慢性胃炎特别是B型慢性胃炎的主要病因之一。
Hp来源尚不明，可能由人与人的接触相传播，经口—口或口—粪途径感染。Hp感染呈世界范围分布，与社会经济状况有关。
感染力极强，国内流行病学调查发现感染率随年龄而增长。慢性胃炎Hp感染率在80%以上，活动性胃炎比非活动性胃炎感染率高。
Hp具有一系列的致病因素，它可在黏液层中自由泳动，定居于胃窦黏膜小凹处及其邻近上皮表面，幽门腺表面的环境似最适于该菌的定居，也可在胃体黏膜散在发现。
细菌可与细胞紧密接触，使其不受胃运动的影响，并产生多种酶及其代谢产物，如尿素酶及其分解产物氨，既能保持细胞周围的中性环境，又能损伤上皮细胞膜。
细菌还分泌多种毒素渗透入黏膜引起细胞受损变性及中性多核粒细胞浸润等炎症反应。
同时，Hp还可刺激机体产生免疫反应引起巨噬细胞和中性粒细胞的浸润。
Hp感染可引起高促胃液素血症，这也是导致高胃酸分泌的因素之一。这些因素的长期存在，可导致黏膜的慢性炎症。
（2）十二指肠液反流：
研究发现慢性胃炎病人因幽门功能失调而常有十二指肠液反流。
十二指肠液特别是其中的胆汁、胰液能溶解黏液，破坏胃黏膜屏障，使H+反弥散入黏膜，进一步引起损伤，而发生慢性胃炎。病变以胃窦部多见。
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